В мире последнее время неспокойно. В логово Акацук проникли посторонние и украли двуххвостого демона. Говорят, Пейн был в ярости. Есть подозрения, что есть ещё несколько тайных организаций, у которых свои цели.
     Хокаге получает странные сведения из всех стран. Какие-то странные шиноби появляются в каждой Скрытой Деревне, все кто встречался с ними в бою живыми не возвращались. Ходят слухи, что им зачем-то нужны джинчурики. Но Хокаге больше всего обеспокоена другим. Три  дня назад к ней пришел сильно раненный АНБУ Листа и проговорил: “В деревне… есть… шпион.” Это были его последние слова.
     Из небытия вернулся Учиха Мадара. Самое странное что он нисколько не изменился и просоединился к шиноби листа, его цели остаются неизвестными.
     Тем временем Пейн захватывает разумы Мизукаге, Раикаге и Тсучикаге, чтобы обявить войну Конохе.
     Что же будет дальше?